Tutkijat löysivät ensimmäisen uuden HIV-kannan sitten 2000

marraskuu 7, 2019

by Cindy Dampier

skannaan HIV-infektoituneen T-solun elektromikografiaa. Luoto: NIAID

tiedemies Mary Rodgers viettää päivänsä jäljittäen tappajia-vaikeasti tavoitettavia, jatkuvasti mutatoivia viruksia, jotka kiertävät maailmaa ja ovat vastuussa miljoonien ihmisten sairauksista tai kuolemasta. Keskiviikkona Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes-lehdessä julkaistussa artikkelissa Rodgers ja hänen tiiminsä Abbottissa yhdessä Missourin yliopiston kirjoittajien kanssa ilmoittivat löytäneensä ensimmäisen uuden hi-viruksen alatyypin, joka on tunnistettu sitten vuoden 2000.

“etsimme jatkuvasti viruksia”, sanoi Rodgers, joka johtaa maailmanlaajuista Virusseurantaohjelmaa Lake Countyssa sijaitsevassa Abbottissa, tutkijaryhmää, joka keskittyy tunnistamaan uusia hepatiitti-ja HIV-kantoja ja seuraamaan tunnistettujen kantojen suuntauksia. “Luulen, että monet ihmiset eivät ehkä ymmärrä, että on olemassa enemmän kuin yksi kanta HIV, ja Abbott teemme testejä kiinni kaikki nämä eri kantoja, joten on tärkeää, että tunnemme kaikki eri tyypit siellä.”

vasta löydetty kanta, nimeltään HIV-1-ryhmän M alatyyppi L, kerättiin ensimmäisen kerran 1980-luvulla Kongon demokraattisessa tasavallassa, mutta vain kaksi näytettä voitiin tutkia geenisekvenssin avulla. Rodgersin mukaan Abbottin tutkijat panivat asian merkille, mutta eivät voineet edetä pidemmälle kohti viruksen uuden muodon varmaa tunnistamista—löydön varmistamiseen tarvittiin kolmas näyte. Vuonna 2001 kerättiin samanmieliseltä vaikuttava näyte, mutta tällä kertaa otosta ei pystytty täysin sekvensoimaan. “Emme pystyneet syntetisoimaan virusta”, Rodgers sanoi. “Näytteen määrä oli aivan liian pieni.”

Abbottin tutkijat ylläpitävät viruskirjastoa, jossa on yli 78 000 näytettä, ja tieto mahdollisesta uudesta HIV-kannasta istui olennaisesti osana kyseistä arkistoa vuoteen 2018 asti. “Olemme aina miettineet, jos siellä olisi toinen alatyyppi”, Rodgers sanoi, ” ja ajattelimme aina, että siellä voisi olla toinen siellä, jos vain jatkaa etsimistä tarpeeksi kauan.”

kuten suuri osa nykyään julkista huomiota keränneestä tieteestä, Rodgersin kylmä tapaus ratkaistiin kehittyneen DNA-sekvensointitekniikan avulla. “Jos ajattelee verinäytteen sisältämän aineiston määrää”, hän sanoi, ” Se on kuin heinäsuopa tietoa, jota voisi sekvensoida. Näytteessä oleva HIV on vain pieni osa näytteestä. Olemme luoneet teknologian, joka toimii magneetin tavoin-vetääkseen neulan heinäsuovasta ja järjestääkseen viruksen.”

tällä sekvensoinnilla alatyyppi l vahvistettiin AIDS-pandemian aiheuttavien HIV-virusten M-ryhmän muunnokseksi. Vaikka tutkijat eivät vielä tiedä, miten Uusi alatyyppi voi vaikuttaa kehoon eri tavalla, on odotettavissa, että se käyttäytyy pitkälti samalla tavalla kuin muut M-ryhmän kannat. Löytö on tärkeä, sanoi AIDS-tutkija Thomas Hope, solu-ja kehitysbiologian professori Northwestern University Feinberg School of Medicinestä, koska taistelu hivin kaltaista virusta vastaan vaatii vihollisen tuntemista. “On tärkeää ymmärtää kaikki kannat, jotka ovat siellä, on tärkeää ymmärtää, että (testi) käytämme kiinni tämän uuden viruksen.”

HIV: n nykyiset hoidot, joilla voidaan vähentää viruskuormaa ja ehkäistä sairauksia, ovat tehokkaita HI-viruksen variantteja vastaan, mukaan lukien uusi alatyyppi, mikä tarkoittaa, että uusi kanta ei ole Uusi kansanterveydellinen kriisi. Mutta ilman kannan tunnistamista lääkärit eivät voi testata sitä. “Vaarallisin skenaario on se, että joku menee lääkäriin ja sanoo, että antakaa minulle HIV-testi, eikä testi nappaa sitä”, Hope sanoi.

ensimmäisen HIV-testin 1980-luvulla valmistanut Abbott suojelee osaltaan tuotteensa elinkelpoisuutta, mikä puolestaan on tärkeää kansanterveydelle.

“ensisijainen huoli on, että HIV saattaa kehittyä niin suureksi, ettei testaaminen toimisi”, Rodgers sanoi. Abbottin testit voivat nyt havaita tämän kannan, ja yhtiö jakaa tutkimuksensa muiden laboratorioiden kanssa, jotka pyrkivät edistämään HIV: n ympärillä olevaa tiedettä. “Emme todellakaan työskentele eristyksissä”, Rodgers sanoi. “Jaamme tämän kannan tiedeyhteisön kanssa, jotta muut voivat työstää kantaa ja toivottavasti se voi edistää asioita, kuten rokotteita ja hoitoja.”

Rodgers tarkkailee myös sitä, löytyykö muita alatyypin l tapauksia, nyt kun kantaa testataan. “Mietimme, voisiko tämä olla yleisempää kuin aiemmin tiedettiin”, hän sanoi.

se, ettei viruksesta ollut löydetty uusia näytteitä vuosiin, voi tarkoittaa, että se jää melko harvinaiseksi, Hope sanoi. Tärkeintä on kuitenkin HIV-varianttien jatkuva dokumentointi.

“emme aio hidastaa”, Rodgers sanoi. “Emme voi koskaan tulla itsetyytyväisiksi, meidän on oltava ennakoivia ja pyrimme pysymään askeleen edellä virusta. Uusien tartuntojen ehkäisemiseksi on ymmärrettävä, miten ne ovat aiemmin levinneet.”

lisätietoja: Julie Yamaguchi et al. Complete genome sequence of CG-0018a-01 establishes HIV-1 subtype L, JAIDS Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes (2019). DOI: 10.1097 / QAI.000000000002246 , journals.lww.com/jaids/Abstrac … 0018a_01. 96307.aspx

lehtitieto: Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.